En artikel publicerad i Nature Medicine visar effektiviteten hos en storskalig databas för demensproteiner som består av identiskt formaterade och lättkombinerbara data. Global Neurodegeneration Proteomics Consortium (GNPC)-databasen är en resurs för forskare som forskar om FTD och andra neurodegenerativa sjukdomar för att bättre förstå de proteinsignaturer som är associerade med sjukdomar. Denna delade resurs kan främja framsteg inom skalbar biomarkörupptäckt genom att eliminera skillnader i dataformat, insamlade datapunkter och begränsningar för dataåtkomst.

AFTD Utbildningsstipendium för klinisk forskning mottagaren Rowan Saloner, PhD, och Accelerating Drug Discovery för FTD Mottagaren Jeffery Rothstein, MD, PhD, är bland medförfattarna till studien. Stipendiet för klinisk forskarutbildning möjliggörs tack vare stöd från Holloway Family Fund, med ytterligare stöd från American Brain Foundation i samarbete med American Academy of Neurology. Accelerating Drug Discovery for FTD stöds av partnerskapet mellan Alzheimer's Drug Discovery Foundation och AFTD.

Analys avslöjar olika proteinnivåer vid olika demenssjukdomar

Denna första GNPC-studie belyste hur deras storskaliga proteindatabas kunde besvara viktiga forskningsfrågor genom att utföra olika analyser, där var och en gav insikt i en specifik aspekt av FTD och andra demenssjukdomar. Denna analys avslöjade hur nivåerna av tusentals separata proteiner varierade mellan demenssjukdomar och återspeglade ett brett spektrum av patologiska förändringar och demenssymtom. Till exempel har blodproteinsignaturer visat sig återspegla bärarstatus för en riskgen som vanligtvis är förknippad med Alzheimers sjukdom.

Det är värt att notera att en grupp proteiner visade sig motsvara svårighetsgraden av klinisk funktionsnedsättning orsakad av FTD, Alzheimers och Parkinsons sjukdom. Höga nivåer av 256-proteingruppen var associerade med lägre kognitiva testresultat och en högre Clinical Dementia Rating-poäng, en allmänt använd skala för att bedöma demens svårighetsgrad. Styrkan i korrelationen mellan nivåerna av proteingruppen och klinisk svårighetsgrad varierade mellan demenstyper, med den starkaste korrelationen vid FTD.

Förutom att ge nya insikter i FTD och andra demenssjukdomar, visar studien nyttan av en storskalig proteindatabas. Att analysera ett stort antal proteiner samtidigt kan inte bara belysa de bakomliggande mekanismerna för demens utan kan också göra det mycket enklare att hitta mål för potentiella läkemedel. Storskaliga databaser kan också hjälpa forskare att förfina metoder för att detektera proteinbiomarkörer och bana väg mot mer tillgängliga diagnostiska verktyg som blodprover.

Internationellt offentligt och privat samarbete bidrog till att bygga proteindatabanken

Som författarna betonar står forskare inför flera utmaningar när de försöker sig på storskalig dataanalys. Några hinder inkluderar de varierande reglerna för datadelning i olika länder och de olika prioriteringarna hos forsknings- och branschorganisationer. GNPC syftar till att ta itu med dessa utmaningar för att stödja utvecklingen av biomarkörer och läkemedel och fördjupa vår förståelse av de bakomliggande mekanismerna för demenssjukdomar, såsom FTD.

För att göra detta bidrog 23 partnerorganisationer inom GNPC, inklusive studier som ALLFTD och institutioner som Mayo Clinic, med data från 18 645 personer med FTD, ALS, Alzheimers eller Parkinsons sjukdom som besökte GNPC:s kliniker. Proteindata kombinerades med demografiska och kliniska data som samlats in vid varje besök.

Datapunkter som mäter samma sak är dock inte alltid desamma, eftersom kliniker och forskare ofta registrerar sina resultat på olika sätt. GNPC arbetade dock för att harmonisera de mätningar de fick, vilket säkerställde att relaterade datapunkter (som mätningar av ett specifikt protein i cerebrospinalvätska hos olika personer) formateras på liknande sätt och kompletterar varandra. Harmoniserade datamängder är viktiga för storskaliga studier, eftersom forskare enkelt kan hitta större mängder data som uppfyller deras behov.

FTD-störningsregistret: Ett kraftfullt verktyg för FTD-forskning

Storskaliga databaser och register över sjukdomar är kraftfulla verktyg för forskare att bättre förstå demenssjukdomar som FTD. Registrera dig på FTD Disorders Registry för att lära dig mer om rekryteringsstudier som matchar dina intressen. Du kan också vara berättigad till den onlinebaserade registerforskningsstudien för att dela insikter om diagnos, familjehistoria, levd erfarenhet, genetiska tester, journaler och mer. Siffror har makt. Ju fler deltagare, desto närmare kommer vi en framtid fri från förlossningssjukdomar.