Internationalt konsortium demonstrerer effektiviteten af storskala proteindatabase i studie
En artikel udgivet i Naturmedicin demonstrerer effektiviteten af en storstilet demensproteindatabase bestående af identisk formaterede og let kombinerbare data. Global Neurodegeneration Proteomics Consortium (GNPC)-databasen er en ressource for forskere, der forsker i FTD og andre neurodegenerative sygdomme, for bedre at forstå de proteinsignaturer, der er forbundet med sygdomme. Denne delte ressource kan fremme fremskridt inden for skalerbar biomarkøropdagelse ved at eliminere forskelle i dataformater, de indsamlede datapunkter og begrænsninger i dataadgang.
AFTD Studiestipendium til klinisk forskning modtager Rowan Saloner, ph.d., og Acceleration Drug Discovery for FTD Modtageren Jeffery Rothstein, MD, PhD, er blandt medforfatterne til studiet. Klinisk Forskningsuddannelsesstipendiet er muliggjort takket være støtte fra Holloway Family Fund med yderligere støtte fra American Brain Foundation i samarbejde med American Academy of Neurology. Accelerating Drug Discovery for FTD støttes af partnerskabet mellem Alzheimer's Drug Discovery Foundation og AFTD.
Analyse afslører forskellige proteinniveauer på tværs af demens
Dette første GNPC-studie fremhævede, hvordan deres store proteindatabase kunne besvare centrale forskningsspørgsmål ved at udføre forskellige analyser, der hver især gav indsigt i et specifikt aspekt af FTD og andre demensformer. Denne analyse afslørede, hvordan niveauerne af tusindvis af separate proteiner varierede på tværs af demensformer og afspejlede en bred vifte af patologiske ændringer og demenstræk. For eksempel har blodproteinsignaturer vist sig at afspejle bærerstatus for et risikogen, der almindeligvis er forbundet med Alzheimers sygdom.
Det er værd at bemærke, at en gruppe proteiner svarede til sværhedsgraden af klinisk svækkelse forårsaget af FTD, Alzheimers og Parkinsons sygdom. Høje niveauer af 256-proteingruppen var forbundet med lavere kognitive testscorer og en højere Clinical Dementia Rating-score, en udbredt skala til vurdering af demenssværhedsgrad. Styrken af korrelationen mellem niveauerne af proteingruppen og den kliniske sværhedsgrad varierede mellem demenstyper, med den stærkeste korrelation i FTD.
Udover at give nye indsigter i FTD og andre demensformer, demonstrerer undersøgelsen nytten af en storstilet proteindatabase. Analyse af et stort antal proteiner på én gang kan ikke blot kaste lys over de underliggende mekanismer for demens, men kan også gøre det meget lettere at finde mål for potentielle lægemidler. Store databaser kan også hjælpe forskere med at forfine metoder til detektion af proteinbiomarkører og bane vejen for mere tilgængelige diagnostiske værktøjer såsom blodprøver.
Internationalt offentligt og privat samarbejde hjalp med at opbygge proteindatabanken
Som forfatterne understreger, står forskere over for adskillige udfordringer, når de forsøger sig med storstilet dataanalyse. Nogle hindringer omfatter de varierende regler for datadeling i forskellige lande og de forskellige prioriteter hos forsknings- og industriorganisationer. GNPC sigter mod at imødegå disse udfordringer for at støtte udviklingen af biomarkører og lægemidler og fremme vores forståelse af de underliggende mekanismer for demens, såsom FTD.
For at gøre dette bidrog 23 partnerorganisationer inden for GNPC, herunder studier som ALLFTD og institutioner som Mayo Clinic, med data fra 18.645 personer med FTD, ALS, Alzheimers eller Parkinsons, der besøgte GNPC-klinikker. Proteindataene blev kombineret med demografiske og kliniske data indsamlet ved hvert besøg.
Datapunkter, der måler det samme, er dog ikke altid de samme, da klinikere og forskere ofte registrerer deres resultater forskelligt. GNPC arbejdede dog på at harmonisere de målinger, de modtog, og sikrede, at relaterede datapunkter (såsom målinger af et specifikt protein i cerebrospinalvæske på tværs af forskellige personer) formateres ens og supplerer hinanden. Harmoniserede datasæt er vigtige for større studier, da forskere nemt kan finde større mængder data, der opfylder deres behov.
FTD-lidelsesregisteret: Et effektivt værktøj til FTD-forskning
Store databaser og lidelsesregistre er effektive værktøjer for forskere til bedre at forstå demensformer som FTD. Tilmeld dig på FTD Disorders Registry for at lære om rekrutteringsstudier, der matcher dine interesser. Du kan også være berettiget til online Registry Research Study for at dele indsigt i diagnoser, familiehistorie, levede erfaringer, genetiske test, patientjournaler og mere. Tal har magt. Jo flere deltagere, jo tættere kommer vi på en fremtid fri for FTD.
Efter kategori
Vores nyhedsbreve
Hold dig informeret
Tilmeld dig nu, og hold dig opdateret med vores nyhedsbrev, begivenhedsalarmer og mere...